사업자의 경우 근로자와 다르게 공제가 안되는 항목이 있음에 유의하여 부부 양쪽으로 공제항목을 적절히 배분하여 부부의 과세표준 구간을 낮추어야 한다.

기본공제와 추가공제, 특별공제 등을 분리해서 받을 수 없으므로, 사업자 공제가 안되는 항목의 공제액이 많은 부양가족의 경우 근로자인 배우자에게 기본공제를 받도록 하는 것이 유리하다.
예) 부모님의 의료비 지출액이 많아 의료비공제를 받는 것이 유리한 경우 부모님 기본공제와 의료비 등의
     특별공제를 근로자인 배우자가 받는 것이 유리

사업자 공제 불가능 항목 : 보험료공제, 의료비공제, 교육비공제, 신용카드공제, 주택청약부금, 주택마련저축공제, 장기차입금이자상환액공제